晴朗时节，江户川柯南（高山南 配音）和毛利小五郎（小山力也 配音）、小兰（山崎和佳奈 配音）以及少年侦探团的伙伴们一同来到京都，他们即将登上自卫队的宙斯盾战舰，体验一把出海作战的感觉，期间还结识了美丽又有着几分神秘的女自卫队员藤井七海（柴咲幸 配音）。谁知快乐的氛围很快被恐慌所替代，战舰上突然发现一

枪杀刑警片冈后，大友（北野武 饰）在韩国代理人张会长（金田时男 饰）的庇护下亡命济州岛。这个远离日本江湖的极道，却因某起事件和花菱会少壮派花田（皮埃尔泷 饰）起了冲突。此时花菱会由前任会长的女婿野村（大杉涟 饰）统领，作为若头的元老西野（西田敏行 饰）则根本不买这个外行老大的账。故而，怀恨在心的野村